Odmiana liczby kopii i wyniki fałszywie dodatnich prenatalnych badań anneuploidalnych

Badania nieinwazyjnego prenatalnego badania przesiewowego pod kątem aneuploidii w analizie krążącego DNA wolnego od komórek (cfDNA) wykazały wysoką czułość i swoistość w kohortach wysokiego ryzyka i niskiego ryzyka. Jednakże ogólna niska częstość występowania aneuploidii ogranicza dodatnią wartość predykcyjną tych testów. Obecnie przyczyny fałszywie pozytywnych wyników są słabo poznane. Zbadaliśmy cztery ciąże z dysharmonijnymi wynikami badań prenatalnych i odkryliśmy, że w dwóch przypadkach powodem powikłań jest matczyne powielanie chromosomu 18. Modelowanie oparte na zmianie liczby kopii numeru populacji potwierdza możliwość, że niektóre fałszywie dodatnie wyniki nieinwazyjnego badania prenatalnego mogą być związane z dużymi wariantami liczby kopii od matek. (Finansowane przez National Institutes of Health i inne.)
Wprowadzenie
Metody nieinwazyjnego badania prenatalnego1 szybko rozwinęły się w praktyce klinicznej, a aneuploidalne badania przesiewowe oparte na analizie krążącego cfDNA są obecnie rutynowo oferowane kobietom z ciążami wysokiego ryzyka. Ze względu na wysoką dokładność tych badań przesiewowych, 2,3 uwagi zostały przeniesione do kohort o niskim ryzyku, w których zmniejszona częstość występowania aneuploidii może ograniczyć dodatnią wartość predykcyjną nieinwazyjnego badania prenatalnego.4 Niedawna prospektywna analiza oparta na cfDNA nieinwazyjne badania prenatalne w 1914 r. Read more „Odmiana liczby kopii i wyniki fałszywie dodatnich prenatalnych badań anneuploidalnych”

Polisacharydowa szczepionka koniugatowa przeciwko pneumokokowemu zapaleniu płuc u dorosłych AD 4

Zgony, ciężkie zdarzenia niepożądane i zdarzenia niepożądane zostały zaklasyfikowane zgodnie ze Słownikiem medycznym dla działań regulacyjnych, wersja 16.1. Wszystkie dane dotyczące bezpieczeństwa zostały podsumowane zgodnie z grupą badawczą. Analiza statystyczna
Populacja z protokołem była populacją pierwotną do analizy pierwszorzędowych i drugorzędowych punktów końcowych oraz większości eksploracyjnych punktów końcowych. Analiza wszystkich epizodów zapalenia płuc nabytego w całej społeczności (w tym niezapalinowego zapalenia płuc) została oparta na zmodyfikowanej populacji, która miała zamiar leczyć.
Łącznie 130 podstawowych zdarzeń w punkcie końcowym było wymaganych do posiadania wystarczającej mocy statystycznej do ostatecznej analizy; liczba ta została określona przy użyciu warunkowego dwumianowego podejścia opisanego przez Breslow i Day, 28 biorąc pod uwagę swoistość i czułość swoistego serotypu testu wykrywania antygenu w moczu. Okresowa analiza przeprowadzona przez komitet monitorujący dane i bezpieczeństwo mniej więcej w połowie badania nie doprowadziła do przerwania badania. Oceny skuteczności i dwustronne przedziały ufności uzyskano przy użyciu metody Clopper-Pearson29 z regulacją alfa do analizy pośredniej. Read more „Polisacharydowa szczepionka koniugatowa przeciwko pneumokokowemu zapaleniu płuc u dorosłych AD 4”

Hematopoeza klonalna związana z wiekiem AD 2

Analiza statystyczna
Wszystkie analizy statystyczne zostały wykonane przy użyciu pakietu statystycznego R (www.r-project.org). Pełne szczegóły analizy statystycznej znajdują się w sekcji Metody w dodatkowym dodatku.
Wyniki
Identyfikacja Mutacji Somatycznych Kandydata
Aby określić stopień klonalnej hematopoezy z mutacjami somatycznymi, przeanalizowaliśmy dane z sekwencjonowania całego egzema z DNA w komórkach krwi obwodowej 17 182 osób, które zostały wybrane bez względu na charakterystykę hematologiczną. Spośród nich 15 801 to pacjenci i kontrole ustalone na podstawie 22 kohort w badaniach stowarzyszenia cukrzycy typu 2, a pozostałych 1381 było wcześniej niesekwencjonowanymi uczestnikami badania Jackson Heart Study, populacyjnego badania kohortowego (Tabela S1 w dodatkowym dodatku). Mediana wieku osób objętych badaniem w momencie uzyskania DNA wyniosła 58 lat (zakres od 19 do 108); 8741 było kobietami, a 7860 chorowało na cukrzycę typu 2.
Identyfikacja somatycznych mutacji kierowcy w przypadku raka pochodzi w dużej mierze z badań, w których porównano różnice w sekwencji DNA między guzem a prawidłową tkanką uzyskaną od tej samej osoby. Po zidentyfikowaniu mutacji badacze mogą genotypować próbki dla tych wariantów somatycznych bez polegania na dopasowanej normalnej tkance. Read more „Hematopoeza klonalna związana z wiekiem AD 2”

Hematopoeza klonalna związana z wiekiem związana z niekorzystnymi rezultatami

Częstość występowania nowotworów hematologicznych wzrasta wraz z wiekiem. Raki te są związane z nawracającymi mutacjami somatycznymi w określonych genach. Postawiliśmy hipotezę, że takie mutacje byłyby wykrywalne we krwi u niektórych osób, które nie mają zaburzeń hematologicznych. Metody
Przeanalizowaliśmy dane z sekwencjonowania całego egzema z DNA w komórkach krwi obwodowej 17 182 osób, które nie zostały wybrane do fenotypów hematologicznych. Szukaliśmy mutacji somatycznych, identyfikując uprzednio scharakteryzowane warianty pojedynczego nukleotydu i małe insercje lub delecje w 160 genach, które są mutacje nawracające w rakach hematologicznych. Obecność mutacji analizowano pod kątem związku z fenotypami hematologicznymi, przeżyciem i zdarzeniami sercowo-naczyniowymi.
Wyniki
Wykrywane mutacje somatyczne występowały rzadko u osób w wieku poniżej 40 lat, ale znacznie wzrastały z wiekiem. Read more „Hematopoeza klonalna związana z wiekiem związana z niekorzystnymi rezultatami”