Hematopoeza klonalna związana z wiekiem związana z niekorzystnymi rezultatami AD 3

W przypadku wariantów na chromosomie X u mężczyzn, liczba ta została podzielona przez 2. Indel oznacza insercje i delecje. Chociaż szukaliśmy mutacji w genach związanych z wieloma różnymi nowotworami hematologicznymi, przede wszystkim zidentyfikowaliśmy geny najczęściej mutowane w AML i zespole mielodysplastycznym. Najczęściej mutowanym genem był DNMT3A (403 warianty) (rysunek 2A i rysunek S2 w dodatkowym dodatku), a następnie TET2 (72 warianty) i ASXL1 (62 warianty). W TET2 tylko eksonu 3 uzyskano przez wychwytywanie egzonu (co odpowiada około 50% regionu kodującego), a część egzonu 12 ASXL1, która odpowiada za około 50% mutacji w tym genie, miała słabą głębokość pokrycia. Tak więc mutacje w TET2 i ASXL1 są prawdopodobnie niedostatecznie reprezentowane w tym badaniu. Inne często zmutowane geny obejmowały TP53 (33 warianty), JAK2 (31 wariantów) i SF3B1 (27 wariantów). Read more „Hematopoeza klonalna związana z wiekiem związana z niekorzystnymi rezultatami AD 3”

Hematopoeza klonalna związana z wiekiem AD 2

Analiza statystyczna
Wszystkie analizy statystyczne zostały wykonane przy użyciu pakietu statystycznego R (www.r-project.org). Pełne szczegóły analizy statystycznej znajdują się w sekcji Metody w dodatkowym dodatku.
Wyniki
Identyfikacja Mutacji Somatycznych Kandydata
Aby określić stopień klonalnej hematopoezy z mutacjami somatycznymi, przeanalizowaliśmy dane z sekwencjonowania całego egzema z DNA w komórkach krwi obwodowej 17 182 osób, które zostały wybrane bez względu na charakterystykę hematologiczną. Spośród nich 15 801 to pacjenci i kontrole ustalone na podstawie 22 kohort w badaniach stowarzyszenia cukrzycy typu 2, a pozostałych 1381 było wcześniej niesekwencjonowanymi uczestnikami badania Jackson Heart Study, populacyjnego badania kohortowego (Tabela S1 w dodatkowym dodatku). Mediana wieku osób objętych badaniem w momencie uzyskania DNA wyniosła 58 lat (zakres od 19 do 108); 8741 było kobietami, a 7860 chorowało na cukrzycę typu 2.
Identyfikacja somatycznych mutacji kierowcy w przypadku raka pochodzi w dużej mierze z badań, w których porównano różnice w sekwencji DNA między guzem a prawidłową tkanką uzyskaną od tej samej osoby. Po zidentyfikowaniu mutacji badacze mogą genotypować próbki dla tych wariantów somatycznych bez polegania na dopasowanej normalnej tkance. Read more „Hematopoeza klonalna związana z wiekiem AD 2”

Hematopoeza klonalna związana z wiekiem związana z niekorzystnymi rezultatami

Częstość występowania nowotworów hematologicznych wzrasta wraz z wiekiem. Raki te są związane z nawracającymi mutacjami somatycznymi w określonych genach. Postawiliśmy hipotezę, że takie mutacje byłyby wykrywalne we krwi u niektórych osób, które nie mają zaburzeń hematologicznych. Metody
Przeanalizowaliśmy dane z sekwencjonowania całego egzema z DNA w komórkach krwi obwodowej 17 182 osób, które nie zostały wybrane do fenotypów hematologicznych. Szukaliśmy mutacji somatycznych, identyfikując uprzednio scharakteryzowane warianty pojedynczego nukleotydu i małe insercje lub delecje w 160 genach, które są mutacje nawracające w rakach hematologicznych. Obecność mutacji analizowano pod kątem związku z fenotypami hematologicznymi, przeżyciem i zdarzeniami sercowo-naczyniowymi.
Wyniki
Wykrywane mutacje somatyczne występowały rzadko u osób w wieku poniżej 40 lat, ale znacznie wzrastały z wiekiem. Read more „Hematopoeza klonalna związana z wiekiem związana z niekorzystnymi rezultatami”

Masowe leczenie z użyciem Arytromycyny w dawce pojedynczej w przypadku odchyleń AD 5

We wszystkich punktach czasowych zidentyfikowano podgrupy podgatunku T. pallidum pertenue wśród członków rodziny. Wszystkie 91 potwierdzonych próbek odchyleń w trzech badaniach było dodatnich dla kilku różnych celów genu T. pallidum i miało sygnaturę molekularną tprL, która określiła je jako podgatunek pertonue. Wszystkie próbki T. pallidum uzyskane przed masową terapią i po niej zawierały rybosomalne DNA 23S typu dzikiego w pozycjach 2058 i 2059, co jest zgodne z podatnością na azytromycynę.
Dyskusja
Nasze badanie wykazało, że jedna runda masowego leczenia azytromycyną znacznie zmniejszyła transmisję i endemiczność odchyleń w wioskach Papui-Nowej Gwinei, które cechowały się wysokim poziomem infekcji. Read more „Masowe leczenie z użyciem Arytromycyny w dawce pojedynczej w przypadku odchyleń AD 5”

2014 Ognisko MERS-CoV w Jeddah – link do zakładów opieki zdrowotnej AD 3

Gdy dostępna była informacja o narażeniu przed wystąpieniem choroby, scharakteryzowaliśmy przyjęcia do placówki służby zdrowia zgodnie z podstawową diagnozą i scharakteryzowaliśmy wizyty w zakładzie opieki zdrowotnej według rodzaju (wizyta w trybie nagłym lub ambulatoryjnym lub wizyty u hospitalizowanych przyjaciół lub rodziny ). Pacjenci z objawami, którzy nie byli pracownikami służby zdrowia i którzy nie mieli żadnej z wyżej wymienionych ekspozycji, uznawani byli za potencjalne pierwotne przypadki. Objawy i objawy zgłaszane przez pacjentów były bezobjawowe
Przeprowadziliśmy ankietę telefoniczną od 26 maja do 8 czerwca 2014 roku, pacjentów, którzy zostali zakodowani przez Ministerstwo Zdrowia i zgłosili się do WHO jako bezobjawowe. Co najmniej cztery próby kontaktu z pacjentami z dostępnymi numerami telefonów. Uzyskaliśmy ustną zgodę od tych pacjentów i przeprowadziliśmy wywiady telefoniczne w języku arabskim lub angielskim.
Próbowaliśmy ustalić, czy w rzeczywistości jeden z następujących objawów pojawił się w ciągu miesiąca przed badaniem PCR, aby wykryć MERS-CoV (okres, który był zgodny z przewidywanym czasem trwania wirusowego zrzucania) 20: kaszel, skrócenie oddechu, wycieku z nosa, bólu gardła, krwioplucia, gorączki, dreszczy, bólu mięśni, bólu brzucha, nudności, wymiotów, biegunki, wysypki, zmęczenia, bólu w klatce piersiowej, bólu głowy, nocnych potów lub innych objawów. Pytania dotyczące wywiadu dotyczyły cech demograficznych pacjentów, ich zawodu oraz podstawowych stanów medycznych, a także przebiegu klinicznego infekcji, powodów testowania w celu wykrycia MERS-CoV oraz historii określonych objawów. Read more „2014 Ognisko MERS-CoV w Jeddah – link do zakładów opieki zdrowotnej AD 3”

2014 Ognisko MERS-CoV w Jeddah – link do zakładów opieki zdrowotnej AD 2

Naszym głównym celem było zidentyfikowanie przyczyny wzrostu zgłaszanych przypadków poprzez scharakteryzowanie możliwych źródeł narażenia oraz określenie epidemiologicznych i klinicznych cech pacjentów z tą chorobą. Ponieważ brakuje danych dotyczących bezobjawowych pacjentów z zakażeniem MERS-CoV, naszym celem drugorzędnym było dalsze scharakteryzowanie bezobjawowych pacjentów w obrębie naszej kohorty. Metody
Pacjenci i nadzór nad badaniem
Ustalono, że wszyscy pacjenci z regionu Jeddah, którym podano doniesienia o potwierdzonej laboratoryjnie infekcji MERS-CoV między stycznia a 16 maja 2014 r. W Arabii Saudyjskiej, przed 13 maja 2014 r., Uznawano osobę za potwierdzoną przypadek zakażenia MERS-CoV, jeśli stwierdzono laboratoryjne potwierdzenie zakażenia MERS-CoV na podstawie dodatniego łańcucha polimerazy z odwrotną transkryptazą w czasie rzeczywistym -reaktor reakcji (RT-PCR) skierowany na dwa geny – gen E i gen ramki odczytu 1a. Wśród osób z potwierdzoną infekcją znalazły się osoby bezobjawowe, które zostały zidentyfikowane przez śledzenie kontaktu, badanie przesiewowe osób z personelu medycznego lub jedno i drugie. Definicja przypadku została zmieniona 13 maja 2014 r., Po czym osoba z potwierdzonym przypadkiem zakażenia MERS-CoV została zdefiniowana jako osoba z potwierdzeniem laboratoryjnym, jak wskazano powyżej, oraz kliniczne lub radiologiczne dowody zgodne z zakażeniem 16-18.
W Arabii Saudyjskiej testy RT-PCR w czasie rzeczywistym dla MERS-CoV przeprowadza się w pięciu laboratoriach regionalnych Ministerstwa Zdrowia Arabii Saudyjskiej, z których jeden znajduje się w Dżuddzie. Read more „2014 Ognisko MERS-CoV w Jeddah – link do zakładów opieki zdrowotnej AD 2”

2014 Ognisko MERS-CoV w Jeddah – link do zakładów opieki zdrowotnej

Znaczny wzrost liczby przypadków infekcji koronawirusa zespołu środkowo-wschodniego (MERS-CoV) wystąpił w Jeddah w Arabii Saudyjskiej na początku 2014 r. Oceniliśmy pacjentów z zakażeniem MERS-CoV w Jeddah w celu zbadania przyczyn tego wzrostu i oceny epidemiologiczne i kliniczne cechy tej choroby. Metody
Zidentyfikowaliśmy wszystkie przypadki potwierdzonej laboratoryjnie infekcji MERS-CoV w Dżuddzie, które zgłoszono do Saudyjskiego Ministerstwa Zdrowia od stycznia do 16 maja 2014 r. Przeprowadziliśmy wywiady telefoniczne z objawowymi pacjentami, którzy nie byli pracownikami służby zdrowia, i dokonaliśmy przeglądu zapisy szpitalne. Zidentyfikowaliśmy pacjentów, u których zgłaszano przypadki bezobjawowe, i przeprowadziliśmy z nimi wywiady dotyczące historii objawów w miesiącu poprzedzającym badanie. Przeprowadzono analizy opisowe.
Wyniki
Z 255 pacjentów z potwierdzoną laboratoryjnie infekcją MERS-CoV zmarło 93 (liczba śmiertelnych wypadków, 36,5%). Read more „2014 Ognisko MERS-CoV w Jeddah – link do zakładów opieki zdrowotnej”

Hematopoeza klonalna związana z wiekiem związana z niekorzystnymi rezultatami AD 6

Uczestnicy z cukrzycą typu 2 mieli nieco większe prawdopodobieństwo wystąpienia mutacji niż osoby bez cukrzycy typu 2 w każdej grupie wiekowej (ryc. S5 w dodatku uzupełniającym). Choroby sercowo-naczyniowe są główną przyczyną śmierci na całym świecie. Biorąc pod uwagę związek mutacji somatycznych z podwyższoną śmiertelnością związaną z przyczynami i związanymi z układem sercowo-naczyniowym, przeprowadziliśmy analizy asocjacyjne danych z dwóch kohort obejmujących 3353 osoby, dla których dostępne były dane dotyczące choroby wieńcowej i udaru niedokrwiennego. Po wykluczeniu osób z wcześniejszymi zdarzeniami, stwierdziliśmy zwiększoną łączną częstość występowania zarówno choroby niedokrwiennej serca, jak i udaru niedokrwiennego u nosicieli mutacji (ryc. S12A i S12B w dodatkowym dodatku). W analizach wielozmiennych, które obejmowały wiek, płeć, status w odniesieniu do cukrzycy typu 2, skurczowe ciśnienie krwi i wskaźnik masy ciała jako współzmienne, wskaźniki ryzyka dla incydentów choroby wieńcowej i udaru niedokrwiennego u osób z mutacją somatyczną w porównaniu z tymi bez mutacji wynosiły odpowiednio 2,0 (95% CI, 1,2 do 3,5; P = 0,02) i 2,6 (95% CI, 1,3 to 4,8; P = 0,003) (rys. Read more „Hematopoeza klonalna związana z wiekiem związana z niekorzystnymi rezultatami AD 6”

Hematopoeza klonalna związana z wiekiem związana z niekorzystnymi rezultatami AD 5

Wpływ mutacji somatycznych na śmiertelność z wszystkich przyczyn. Panel A jest działką leśną ryzyka zgonu z dowolnej przyczyny związanej z posiadaniem klonu somatycznego, wśród uczestników z kohorty JHS, kohorty Ashkenazi z projektu Longevity Genes (UA), MEC, Finlandia-Stany Zjednoczone Kohorty badania genetyki NIDDM (FUSION) i kohorty badania Botnia. Pudełka wskazują współczynnik ryzyka dla pojedynczej kohorty, z liniami poziomymi wskazującymi 95% przedziały ufności, a diamenty przedstawiają wyniki metaanalizy ze stałymi efektami dla wszystkich kohort. Wszystkie modele obejmowały grupy wiekowe (<60 lat, 60 do 69 lat, 70 do 79 lat, 80 do 89 lat i 90 lat lub więcej), status w odniesieniu do cukrzycy typu 2 i płeć jako współzmienne w proporcjonalnych zagrożeniach Coxa analiza. Badanie Botnia obejmuje rodzeństwo Helsinki z kohortą cukrzycową i dane z rejestru cukrzycy Scania. Panel B pokazuje krzywe przeżycia Kaplana-Meiera wygenerowane z danych z tych samych kohort, co te z panelu A. Lewy panel zawiera dane od uczestników, którzy byli młodsi niż 70 lat w momencie stwierdzenia DNA, i prawy panel danych od uczestnicy, którzy ukończyli 70 rok życia. Read more „Hematopoeza klonalna związana z wiekiem związana z niekorzystnymi rezultatami AD 5”

2014 Ognisko MERS-CoV w Jeddah – link do zakładów opieki zdrowotnej AD 4

Ekspozycja przed wystąpieniem choroby nie była oceniana u 18 pacjentów z powodu niewystarczającej historii medycznej (ryc. 2). Pacjenci, z którymi kontaktowano się telefonicznie i którzy oceniali potencjalne narażenia, byli istotnie bardziej narażeni na przyjęcie na OIOM niż ci, dla których nie mogliśmy ocenić ekspozycji (P <0,001) (Tabela 1). W przeciwnym razie oceniane cechy były podobne w obu grupach. Tabela 2. Tabela 2. Rodzaje wtórnej ekspozycji na MERS-CoV u 109 pacjentów w ciągu 14 dni przed wystąpieniem objawów. Read more „2014 Ognisko MERS-CoV w Jeddah – link do zakładów opieki zdrowotnej AD 4”