Ekspresja mikroRNA, przeżycie i odpowiedź na interferon w raku wątroby czesc 4

Dane w panelach od A do C są względnymi poziomami ekspresji log2, znormalizowanymi do wartości w próbkach wolnych od choroby od ośmiu osobników kontrolnych. Panel D pokazuje przeżycie w zależności od poziomu ekspresji miR-26a-1 w próbkach nowotworu, jak określono za pomocą analizy mikromacierzy, przy użyciu testu log-rank. Mediana poziomu ekspresji została wykorzystana jako wartość graniczna. Zmniejszona ekspresja miR-26 u 106 pacjentów została sklasyfikowana jako wartości poniżej 50. percentyla (ze średnią redukcją tkanki nowotworowej w porównaniu z tkanką niedrukowaną, o czynnik 2,69). Wysoką ekspresję miR-26 u 111 pacjentów sklasyfikowano jako wartości powyżej 50. percentyla (przy średnim zmniejszeniu tkanki nowotworowej, w porównaniu z tkanką niedotyczącą, o współczynnik 0,98). U ludzi jest trzech członków miR-26: miR-26a-1, miR-26a-2 i miR-26b; miR-26a-1 został wybrany do dalszej analizy, ponieważ różnica w jego poziomie między płciami była najbardziej znacząca i była najobficiej. Analizy danych od 224 pacjentów w kohorcie wykazały, że ekspresja miR-26a-1 w prawidłowej tkance wątrobowej była istotnie wyższa u kobiet niż u mężczyzn (Figura 1A). To stwierdzenie zostało potwierdzone przez określenie dojrzałej ekspresji miR-26 u 26 kobiet i 56 mężczyzn dopasowanych do wieku za pomocą qRT-PCR (rysunek 1B).
Następnie stwierdziliśmy, że miR-26 może działać jako gen supresorowy guza, a jeśli tak, wyciszanie miR-26 byłoby częstym zjawiskiem w nowotworach. Analizy wykazały, że znaczącą redukcję ekspresji miR-26a-1 w nowotworach, w porównaniu z ekspresją w próbkach nieuszkodzonych, obserwowano u pacjentów z niskim poziomem ekspresji miR-26 (P <0,001), ale nie u tych z wysokim poziomem miR. -26 ekspresja (P = 0,23) (Figura 1C). Mediana zmiany czynnika ekspresji w nowotworach w porównaniu z osobami nietolerującymi wynosiła 0,37 u pacjentów z niską ekspresją miR-26a-1 i 0,98 u pacjentów z wysoką ekspresją miR-26a-1, co sugerowało, że wyciszanie ekspresji miR-26 był związany tylko z niską ekspresją miR-26. Co więcej, niska ekspresja miR-26, w porównaniu z wysoką ekspresją, była związana ze zmniejszonym przeżyciem (Figura 1D). Wzorce ekspresji wszystkich trzech członków miR-26 i ich związków z przeżyciem były podobne (rysunek w dodatku uzupełniającym).
Nowotwory z niskim ekspresją miR-26
Figura 2. Figura 2. Wyraźne aktywności transkrypcyjne w raku wątrobowokomórkowym z niską ekspresją miR-26. Panel A pokazuje wielowymiarowy wykres skalowania, oparty na ekspresji 11,580 genów, dla 224 pacjentów z rakiem wątrobowokomórkowym. Wykresy są umieszczone w trójwymiarowej przestrzeni, obejmującej pierwsze trzy główne składniki tych genów. Poziom ekspresji miR-26 został zdekotomizowany na podstawie wartości mediany jako niskiej (niebieski) lub wysokiej (czerwonej). Panel B pokazuje aktywację sieci genów sygnalizacji między czynnikiem jądrowym .B (NF-.B) i interleukiną-6 (IL6) w nowotworach o niskiej ekspresji miR-26. Zacienione owale reprezentują regulowane w górę geny w nowotworach o niskiej ekspresji miR-26, a otwarte owale reprezentują geny, które nie znajdują się na liście istotnych genów, ale są zgłaszane jako powiązane z siecią. Otwarte owale oznaczone jako NF-.B, I.b i IKK reprezentują odpowiednio węzły molekularne związane z kompleksami białkowymi NF-.B, inhibitorem NF-.B i kinazą I.b.
[patrz też: Gliwice stomatolog, stomatolog olsztyn, forum kulturystyczne ]

Powiązane tematy z artykułem: forum kulturystyczne Gliwice stomatolog stomatolog olsztyn